清水浸種，清水浸種是指將種子放在適宜水溫和充足水量的清水中促使種子在短期內充分吸脹的措施，根據浸種的水溫，又分為涼水浸種、溫水浸種和熱水燙種三種方法。
1、涼水浸種，用30度左右的涼水浸總，用水量為種子體積的4~5倍浸泡時間一到三天，讓種子充分吸水這種方法適用於種皮薄，吸水快易發芽，不受病蟲害的種子，如白菜，橄欖，豆類等，高溫季節播種喜涼的蔬菜，如芹菜，菠菜萵筍等，這種方法安全簡單，但種子吸水慢，也沒有消毒的作用，芹菜，胡蘿蔔，菠菜的浸種時間為1~2天；萵筍種子浸種時間7~8個小時；十字花科的蔬菜的種子浸種時間在4~5個小時；豆類蔬菜淨浸種的時間1～2個小時，浸種時間超過12小時以後，應每隔12小時換一次水。
2、溫水浸種，溫水浸種所用水溫為55到60℃，用水量為種子的5~6倍種，時間20~30分鐘。種皮薄的種子，如番茄，黃瓜，辣椒等，浸種時間一般為20分鐘；種皮厚的種子，如苦瓜，冬瓜，西瓜等，浸種時間要達到30分鐘；浸種時間到了以後不再新增熱水，讓水溫自然降到30度左右，繼續浸泡種子保證種子充分吸水。不同蔬菜種子浸泡的時間是不同的，如茄果類種子需要浸泡4～6個小時內；豆類種子泡兩2～4個小時；南瓜泡8~11個小時；黃瓜浸4～6個小時；冬瓜和絲瓜種子需要8~11個小時；苦瓜12~24個小時；西瓜、胡蘿蔔、菠菜種子浸浸24個小時；蘿蔔白菜浸1～3個小時；芹菜種子12~24個小時；甘藍2個小時。溫水浸種具殺死種皮表面的病菌、促進種皮變軟、促進種子吸水的作用，這種方法比較穩當，適宜所有的種子。
3、熱水燙種，適宜一些不易發芽的種子，先用涼水浸沒種子然後倒入80~90℃的熱水，邊倒邊攪拌用溫度計測量溫度，當溫度達到70度左右，停止加入熱水止，沿著一個方向繼續攪動，通過一到兩分鐘以後再注入涼水一直攪動到水溫下降到30度左右為止攪。這種方法適用於總皮厚，透水困難的種子，如苦瓜、冬瓜、西瓜等這種方法的好處是有一定的殺菌作用，且可以縮短浸種時間，但浸種的水溫和時間掌握不好，容易燙傷種子種，種皮薄的種子不宜採用這種方法。