接木是牡丹最常用的繁殖方法，具有成本低、速度快、繁殖係數高、苗木整齊規範等優點。影響接木存活的因素主要有接木時間、砧木、接穗和接木方法等幾個方面。
1、接木時間
牡丹自8月下旬（處暑）到10月上旬（寒露）期間均可接木，以白露（9月7日-8日）到秋分（9月23日-24日）為宜，特別是以白露前後接木存活率最高，這可能是牡丹接木對特定溫度和溼度的反應，白露前後，氣溫在20-25℃,30cm深地溫為18-23℃,介面處很快便會癒合及產生愈傷組織，所以存活率高。接木在野生芍藥的實生砧上，置於恆溫恆溼箱內，不管是8月下旬-9月下旬，還是11月初接木，存活率均達90%以上。根據這個試驗，如果我們能建立一個類似於「白露」前後的小環境，則可以將牡丹的接木時期延長四個月以上，這對於實現牡丹的工廠化生產有著重要的意義，牡丹科研工作者應該將其作為一個重要的課題進行研究。
2、砧木
牡丹接木最初（宋朝）以挖掘野生牡丹作為砧木，明代則開始用芍藥根作為砧木。現在，砧木既可以用芍藥根，也可以用牡丹根。芍藥根以芍藥品種「粉玉奴」的根為主，產根量大，根粗細長短均勻，適應性廣，生長勢強，價格低廉。另外，一般芍藥品種的根也可以作為砧木，但因其種苗價格較高，砧木用量大時就不划算了。牡丹根以牡丹品種「鳳丹」的根為主，近年來，以點播後連續生長2-3
年的鳳丹實生苗或1年生鳳丹苗重新分栽再生長2-3年的根為主，產量高，規格一致，抗病、耐鹽鹼、生長勢強，可直接定植，是作為牡丹接木用砧木的發展方向，應大力宣傳、推廣。
砧木晾曬1-2天，失水變軟後進行接木，這樣切口不易劈裂，便於操作。
3、接穗
接穗最好採自母株基部的當年生萌櫱枝（由土芽長成的枝條），其組織充實，生命力旺盛，基部容易發生新根及萌生新枝，接後存活率高。但是，有些品種的萌櫱枝很少，只能採用樹冠上部的一年生
枝條作為接穗。接穗長度一般為5-10cm,粗度0.5cm以上，帶有2-3個充實飽滿的芽。近年來，為加大繁殖係數和種苗的規格化生產，正在積極推廣「單芽」接穗。接穗中部組織充實並呈現白色，接後容易存活，中部組織疏鬆，呈現褐色、黑色的枝條不宜做接穗。接穗最好隨採隨接，久放則影響存活率。如果短時間存放（1-3天），可置陰涼處並分層埋入墒情適中的土壤中，並注意防雨。長途運輸，接穗應放入裝有溼苔蘚的塑膠袋內，溫度以5-10℃為宜。
4、接木方法
牡丹接木繁殖，以其使用的接穗、砧木和接木部位的不同，可分為裸根嵌接，就地劈接、單芽切接、單芽貼接和方塊芽接等方法。
(1)裸根嵌接：
用接木刀將接穗下端2-3cm處的兩側對稱各斜削一刀，使之成為一邊帶皮的三稜尖頭。然後用接木刀將根砧（芍藥根、牡丹根或「鳳丹」實生苗的根）頂端削平，之後將根砧平放在一木板（或木橙）上，從根砧頂端的側面中心線向中心縱切一條深達砧木2/3的切口（如果砧木和接穗粗度基本相同，可將砧木切透），切口縱長略長於接穗削麵2-3mm,將接穗較薄的一稜（沒有皮）對準根砧的切口嵌入，以兩側形成層對準為度，接穗帶皮層的稜面露於外邊，然後用細麻繩或麻皮將接合部位自上而下綁緊，並用稀泥漿封抹介面（亦可用蠟封），接木好的苗要隨接隨栽，否則會影響存活率。
栽植時，株行距以10×50cm為宜。栽植溝深25-30cm,寬10-15cm,將接木苗按株行距放於溝內，回填土，填時抓住砧木向上輕輕提或晃動，並使介面低於地平面2-3cm,過深嫁家苗不易存活，即使存活後長勢也不旺；過淺不易長根。用木棍把砧木周圍的土搗實（注意勿觸動接穗），然後用周圍細土將接穗輕輕蓋住，並順行封成土埂，高度以超出接穗3-5cm為宜，輕拍土埂表土，以利保墒越冬。
(2)就地壁接：
一般採用較粗的3-4
年生鳳丹實生苗做砧木，不將砧木挖起，直接就地接木。先扒去砧木周圍5-10cm深的表土，露出根莖部位，保留根莖長度3-4cm,將其上面的枝條剪去，下面的隱芽抹去，修平根莖上端面，用接木刀將根莖劈開，然後插入已削好的接穗。接穗削法和操作過程與裸根嵌接法基本相同，只是外側稜稍薄。
就地劈接的優點是不損傷砧木的根系，接木存活率高，苗木生長勢強。缺點是操作較費勁，陰雨天不便進行作業。
(3)單芽切接：
這種接木方法是擴大接木繁殖係數，統一接木苗規格的極好的方法。首先剪取接穗，每個接穗長2-3cm,只有1個側芽（或頂芽），手捏接穗頂端，用接木刀向下端使勁一刀削下，削切面長1-2cm,應光滑。然後，向削切面之反面下端0.5cm斜切一刀，稍露出形成層即可。
在砧木橫斷面肩部稍斜切一刀，然後向下垂直切一縱口，其寬度、長度和接穗的切削麵基本相同。將接穗插入切口，使它的形成層與砧木的形成層左右兩邊都對齊（或一邊對齊）。插入接穗時，接穗的切削麵要恰好插到底，但其最上部的切口最好比砧木的橫斷面高出約1mm,露出白色木質部，從這一線白的地方發生旺盛的愈傷組織。最後，用細麻繩綁緊，稀泥漿抹嚴切口，即可栽植。
(4)單芽貼接：
接穗及接穗的削切方法與單芽切接相同。在砧木頂端自上而下，由深（約1/2）而淺(1/6)斜切一刀，勿切透，切口長約2cm,再於切口下部約0.5cm處斜切一刀，一直切到下部刀口處，通過所切的這上下兩刀，一塊較薄的砧木片可自然落下，然後將接穗與砧木貼上在一起，使接穗和砧木一邊的形成層對齊，用左手大拇指壓緊，右手綁繩，抹泥漿後即可栽植。
(5)方塊芽接：
方塊芽接在5-9月均可進行，尤以7-8月存活率最高。首先，選擇健壯飽滿的腋芽，在芽上下0.5-1cm處各橫切一刀，離芽左右約0.5cm處各縱劃一刀，使之成方形或長方形的芽塊，繼而剝下。以同樣的方法再剝去砧木植株上同樣大小的腋芽，注意不要碰壞芽眼，馬上將削下的芽塊與砧木上被剝去的地方貼好，芽眼要對齊，四邊切口的皮層對緊對齊，尤其是上下切口，然後用塑膠條上下交叉綁緊，讓葉柄露在外面，10天以後即可癒合，以此方法可以在同一植株上接木多個顏色的品種，成為「什樣錦」，也可用於改換觀賞品質差的品種。
5、長根劑等藥品在牡丹接木中的應用
為促進接穗和砧木癒合及萌生新根，提高接木存活率，可以用300-500mg/L的吲哚丁酸、ABT發根粉等長根劑速蘸接穗，晾乾後切削；用30-50mg/L的長根劑速浸砧木，晾乾後備用，還可以在稀泥漿中摻入50-100mg/L的長根劑，另外，為防止介面腐爛，稀泥漿中還可以摻入適量殺菌劑。
6、接木後的管理
接木苗栽植後應加強管理，禁止人及畜進入觸動封土。在洛陽和菏澤一帶，如果是在10月中下旬接木，栽植後應立即於封好的土埂上覆蓋一層塑膠薄膜，或者在封好的土埂上搭設高20-30cm,寬30- 50cm的小拱形架，上蓋塑膠薄膜，以提高地溫，促進長根，可明顯提高存活率，以搭設隧道棚為最佳。翌年2-3 月氣溫回升時，去掉薄膜，把土埂上部土層稍微鬆一鬆，以利接穗萌發出土。如果土層較厚，可去掉一部分，但在頂芽上部的土仍應留3-5cm,讓幼芽自行長出，不宜把幼芽扒出土外，以防受凍害（倒春寒）。枝梢展葉以後，就要進行中耕除草鬆土和病蟲害防治等日常管理工作，若有花蕾出現，應及時摘除，以集中養分供應苗木生長。砧木介面以下萌發的新枝，要及時抹掉，如果土壤乾旱，可開溝滲澆，勿漫灌。
7、接木苗的移植
接木苗一般在育苗圃集中培養2年，方可移植於大田分開定植。2年生的接木苗每株可長出10-20條粗約0.6-1cm,長約25-35cm的新根，於大田定植後存活率高，生長勢旺。
移植時，如果接穗新根萌發較少，而砧木又是芍藥根，可剪去砧木的1/2-2/3;如果新根多，可將砧木全部去掉；用牡丹根、鳳丹實生苗做砧木接木的，不必剪去砧木，可原株移植。
因接木苗新根少，根的木質化程度低，勿須晾曬，最好隨掘隨栽。栽植方法可參考分株繁殖的栽植方法。