一，養殖水體底部滋生青苔的原因
青苔是養殖水體中的大型藻類過度繁殖形成的，主要包括水綿藻，水網藻，剛毛藻，基枝藻，轉板藻等種類。養殖水體中青苔的來源主要有上一個養殖週期的養殖過程中清塘不徹底，養殖的水源水沒有徹底處理後進入池塘或者養殖週期之間的加水，以及河蟹，龍蝦的養殖過程中的水草的種植，螺的投放的引入。養殖水體底部滋生青苔的原因主要有以下2類。
1，對於已經滋生青苔的池塘在進入下一造養殖前未能清塘或者清塘不徹底，進水之後由於未能及時把水耕肥，透明度過高而滋生青苔。
2，養殖水體底部青苔滋生的原因主要是由於養殖水體開始養殖時，水體各種原因水一直肥不起來，或者放苗後補肥不及時導致藻類的繁殖跟不上消耗，從而使養殖水體變清，水體透明度高，陽光直射塘底，有利於底棲藻類的繁殖，池塘底部青苔的生長。
另一種情況就是養殖中藻類倒藻後水變清，養殖水體的死藻、有機碎屑大量沉底，加上水清澈見底陽光可直射塘底。塘底就很容易起泥皮、青苔類等絲狀藻類。一旦塘底生長了大量的青苔，由於青苔吸肥很厲害，水中的浮游藻類無法吸收到足夠的肥很難維持生長繁殖，水就會清澈見底而且很難再肥得起來！有青苔的池塘往往補肥越多，青苔長得越多，水反而就越清……
二，養殖水體底部滋生青苔的危害：
1、青苔大量繁殖後，消耗了水體中的營養物質，與水體當中的浮游藻類爭奪營養，使浮游藻類得不到足夠的營養物質而生長繁殖緩慢，養殖水體肥水困難，水質變得清瘦。
2、在河蟹養殖的過程中，青苔（主要是剛毛藻）吸附在水草上，阻礙了水草的光合作用，導致水草生長不旺，淨化水質的能力削弱，進而影響水質。
3、青苔死亡後的有機物分解後產生硫化氫和羥胺等有毒物質，引發水質發黑、發臭，氨態氮含量超標，有機物大量分解消耗水中的溶解氧，造成水體中溶解氧含量偏低。
4，養殖池底大量滋生青苔後，影響了水生動物的活動空間，由於青苔如棉絮狀，蝦，蟹苗，魚苗，海參等進入到青苔當中，或者蟹剛脫殼，體質弱的階段，容易被青苔所裹挾，無法掙脫，最終死亡。
三，養殖水體底部滋生青苔的預防及處理方案
（一）預防
1，清塘後排乾池水曬塘，然後將池底淺耕翻曬，利用陽光和乾燥的環境殺死青苔及其孢子。
2，將生石灰加水稀釋化漿之後，不待冷卻即潑灑在池塘底部的青苔聚集處，利用生石灰灰加水稀釋之後產生的高pH和熱將青苔殺死，或者用漂白粉加水稀釋之後潑灑在青苔聚集的地方殺死青苔。
（二）處理方案
1. 人工撈除：人工撈除的方法適用於青苔大量繁殖的池塘，缺點是帶來的工作量較大，不可能完全撈乾淨，斷裂的部分在水中可再次分裂增殖。且沒有從根本上改變水體中青苔的生長環境，撈除後又會再次生長繁殖。因此只適合於在青苔大量繁殖時撈除部分割槽域的青苔或者撈除重的成團的死亡青苔，可以作為青苔處理的輔助手段。
2，對池塘底部滋生的青苔進行遮光處理，讓其得不到光照自行死亡。
避免直接施放太多的肥，而應該根據青苔需要陽光直射至塘底的特點，加深池塘水位，然後投放腐植酸鈉等進行「遮光」，通過遮擋光線來抑制青苔的生長。另外腐殖酸鈉中還含有藻類生長的部分微量元素，能夠抑制青苔的同時促進浮游藻類的生長。
然後再引進新鮮的水源及富含良好藻類的藻水進池塘（可以選用蓄水池培好藻做「藻種」或直接引進其它塘含優良藻類的塘水），施放水溶性好的胺基酸液態肥或肥水膏類的肥水產品和菌種豐富的EM菌，利用EM菌將沉積在底部的有機物分解成便於藻類吸收利用的小分子營養物質，把池塘的優良的藻類培起來形成優勢，讓底層的青苔得不到光照自然死亡。
很多觀點主張用硫酸銅甚至是撲草淨去殺，這些對水生動物都具有相當大的毒性，撲草淨甚至是國家的水產禁用藥物。這些不僅對水生動物有較大的影響，而且還會對整個養殖水環境影響較大，導致後續的肥水困難。
建議處理方案如下：
1，死亡後重的成團的青苔可以人工撈出，之後再用腐殖酸鈉對水體進行遮光處理，用量為1-2千克畝/米，或者使用沸石粉加水稀釋潑灑，對池底的青苔進行覆蓋遮光處理。
2，第二天使用底質淨化顆粒（主要成分為過硫酸氫鉀，用量為1包4-5畝）或者安藍（1包5畝）直接幹撒，進行改底，處理沉積在池塘底部的青苔。
3，第3天引進新水之後使用肥水EM菌（1公斤用1-2畝）+水美（磷肥，每畝。米水體100克）+藻種100克每畝。米，配合胺基酸肥水素（1-1.5千克每畝。米）進行培藻。
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